Konstrukcija karoserije vozila Citroën C1 postavlja najviše standarde na području zaštite putnika:
- prednji i stražnji kraj imaju unutarnju konstrukciju karoserije bočno uz krov i iznad vrata s ugrađenim elastičnim područjima;
- podvozje i stupići vjetrobranskog stakla dizajnirani su za apsorbiranje i raspršivanje energije prema stražnjem kraju vozila;
- šipke ojačanja u vratima štite putnike od bočnih udaraca.

Citroën C1 postavlja najviše standarde na području zaštite putnika sa do šest zračnih jastuka:
- dva prednja zračna jastuka (zračni jastuk suvozača može se isključiti za postavljanje dječje sjedalice sprijeda);
- četiri bočna zračna jastuka koja štite prsni koš i trbuh putnika;
- dva zračna jastuka zavjese za zaštitu glava putnika sprijeda i straga.

Citroën C1 se isporučuje s posebno kompleksnim kočionim sustavom:
- dva ventilirajuća diska sprijeda;
- ABS (sustav protiv blokiranja kotača) koji elektronički podešava tlak kočenja kako bi spriječio blokiranje kotača;
- Elektronički razdjelnik sile kočenja (EBD) koji ravnomjerno raspodjeljuje silu kočenja na sve kotače;
- CSC (Sustav za nadzor stabilnosti u zavojima) za zadržavanje vozila na zadanoj putanji ako vozač zakoči prilikom ulaska u zavoj.

ESP (Elektronički sustav za nadzor stabilnosti vozila) pomaže vozaču da zadrži kontrolu nad vozilom i u najtežim situacijama: Djeluje na raspodjelu sile kočenja i broj okretaja motora kako bi zadržao stabilnost automobila u slučaju gubitka prianjanja na tlo u zavojima.

Stražnje sjedalo (s 50/50 djeljivim naslonom) ima Isofix sjedišta sa sidrištima za učvršćenje, za sigurno postavljanje dječjih sjedalica.