Citroën C5 Tourer ima vrata prtljažnika s električnim upravljanjem te:
- funkcijom automatskog otvaranja i zatvaranja putem daljinskog ključa, kako iz unutrašnjosti vozila tako i izvana;
- funkcijom protiv priklještenja koja sprječava zatvaranje vrata prtljažnika ako otkrije prisutnost nekog objekta.

2/3-1/3 djeljiva i preklopiva stražnja klupa u preklopljenom položaju oslobađa potpuno ravan tovarni prostor zapremnine 1.490 dm3 (533 dm3 u standardnoj konfiguraciji sjedala). Prtljažnik je poprilično velik:
- maksimalna širina između koševa blatobrana iznosi 1.115 mm;
- maksimalni prostor za glavu iznosi 851 mm;
- maksimalna dužina (s preklopljenim stražnjim sjedalom) iznosi 1.723 mm..

Visina praga prtljažnika može se povećati ili smanjiti za do 6 cm (na izvedbi s Hydractive III+ ovjesom) putem gumba na desnoj strani prtljažnika. Čim se motor uključi, ovjes se vraća u normalni položaj.

Citroën C5 Tourer se isporučuje s dvije vrste mreže za osiguranje tereta:
- mrežom za prijevoz predmeta na podu;
- mrežom koja se može odmotati i pričvrstiti iza prednjeg ili stražnjeg sjedala kako bi spriječila probijanje predmeta u putnički prostor ako vozač naglo zakoči. Kuke za vrećice postavljene su s obje strane prtljažnika.

Citroën C5 Tourer ima i pokrov za prtljagu na namotavanje za skrivanje sadržaja prtljažnika od znatiželjnika.

Uz standardno svjetlo prtljažnika, prijenosna svjetiljka je postavljena s desne strane u prtljažniku:
- za dodatni izvor svjetla kada je postavljena;
- kao svjetiljka koja radi 45 minuta kada se skine.